通过高通量的单细胞分析技术来解析组织中的细胞多样性，这不仅开辟了新的研究途径，还推动了新的研究发现。只有与组织、细胞空间位置信息相结合，这些单细胞研究的新发现才会变得更加丰富。对细胞空间模式的探索可以揭示正常和病变组织结构、免疫应答以及神经组织复杂分布的大量细节。

在真实组织环境中对细胞进行原位分析

原位分析

Xenium原位分析技术直接检测并保留组织切片中数百个RNA靶点的细胞定位，无需常规测序技术辅助。这为研究人员提供了一张详细的基因表达模式图，且无需牺牲分辨率或靶点数量。

Xenium原位分析技术使用针对靶点基因特异性的可环化探针和目标RNA杂交，再通过环状探针原位滚环扩增，扩增可供荧光标记探针杂交的基因特异性空间标签序列。在Xenium分析仪上进行多轮荧光标记探针的杂交，每一轮杂交反应中，荧光标记探针和基因特异性空间标签序列杂交，通过高分辨率显微镜扫描图像，检测每个荧光探针的位置，然后将荧光探针移除。连续几轮的荧光探针杂交、成像和移除会在每一个特定探针杂交的位置产生荧光颜色“开"关模式，并而形成荧光信号组合特征条形码，揭示组织中每个细胞内每个位置的RNA身份信息。未来，Xenium还能够检测同一组织切片中的RNA和蛋白质表达水平，从而实现组织中复杂而精准的表达模式分析。

通过Xenium原位分析来构建空间转录组图谱。将新鲜冷冻或FFPE组织切片放在Xenium玻片上。对切片进行处理，获取RNA后用可环化的基因特异性DNA探针进行标记。接着，探针连接后产生可酶促扩增的环状DNA探针。将玻片置于Xenium分析仪内进行多轮的荧光探针的杂交、成像、解码和数据处理。

应用范围和研究领域

Xenium原位分析技术，帮助研究人员能够确定细胞在其原始组织中的特定位置的基因、蛋白表达模式，获取详细的空间信息，该技术将助力多个重要应用领域的研究快速发展，包括：

肿瘤学

揭示肿瘤和免疫微环境中异质性的空间特征，并确定具有潜在治疗影响的生物标志物。

免疫学

表征免疫系统和空间定位如何应答传染病、过敏性炎症和自身免疫性疾病。

神经科学

揭示复杂神经组织中应对疾病和创伤的空间表达模式。

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